一颗山楂引发的“头脑风暴
去年，颗引北京大学生命科学学院研究员李晟等人发表在《自然-生态与演化》的一篇研究报告（Retreatoflargecarnivoresacrossthegiantpandadistributionrange），颗引展示了大型食肉动物在野生大熊猫分布区减少的大趋势，研究认为，不应过度依赖于单一物种保护策略来保护某地区的生物多样性。 山楂（f）显示来自该途径的Z-A变体的结合特异性变化的矩阵。（b）LL2测序数据中LL1型序列的部分，头脑以及LL1测序数据中LL2型序列的部分。
这个共同进化复合物的大型数据集推动了对Z结构域-粘附体对之间的分子识别的系统级分析，风暴涵盖了广泛的结构、风暴亲和性、交叉反应性和正交性，并捕获了广泛的共同进化网络。随后在在一个共同进化网络中绘制了这些序列，颗引并确定了10对提供特异性细节的结构。山楂原文详情：Deployingsyntheticcoevolutionandmachinelearningtoengineerprotein-proteininteractions(Science2023,381,eadh1720)本文由赛恩斯供稿。
（d）显示三个正交LL2突变体LL2.c17（VFLV+IVVY）、头脑LL2.c7（LVLF+FIVK）和LL2.c22（IVFF+FILV）的库位置中的氨基酸的表，以比较它们的亲和力和结构的差异。风暴这些方法的整合为生物技术和合成生物学提供了一种模拟蛋白质协同进化和产生具有多种分子识别特性的蛋白质复合物的手段。
最后使用预训练的蛋白质语言模型来扩展氨基酸对的范围，颗引证明了这种混合实验-计算方法对该系统中蛋白-蛋白相互作用的预测能力。 相互作用的蛋白质通过对突变的采样（主要是在蛋白-蛋白界面）共同进化了数千年，山楂以实现所需功能的最佳匹配，这一过程很难在实验室中重现。虽然从官方的角度来说负面消息不间断，头脑但是从业者却对它追崇备至。 今年10月，风暴5位科学家从Elsevier辞去编辑职位，ProjektDEAL的联盟的多位领导人警告称，这5人只是众多准备从爱思唯尔辞职的第一批科学家。由德国图书馆、颗引大学、研究机构组成的联合战线——ProjektDEAL联盟，数年之前就与Elsevier展开了谈判。 2012年1月，山楂英国剑桥大学数学家、菲尔兹奖获得者TimothyGowers发起了一场抵制Elsevier的运动，并有上万名科学家签名响应了不发表、不审核、不当编辑。科学家辞职、头脑抗议也不是头一回了。 |
